卵巢早衰指女性40岁前出现卵巢功能减退，发病率在一般女性人群中约为1%~3%。
遗传因素导致
染色体异常： 比如X染色体缺失或结构异常等遗传问题，会直接影响卵巢的正常功能。像特纳综合征，就是由于性染色体异常引起的，患者常伴有卵巢早衰的表现。基因突变： 某些特定基因的突变也可能与卵巢早衰相关，例如FOXL2基因等发生突变时，可能干扰卵巢细胞的正常生长、发育和功能维持。
自身免疫性疾病影响
甲状腺疾病： 患有自身免疫性甲状腺炎等甲状腺疾病时，身体的免疫系统会错误地攻击甲状腺组织，同时也可能波及卵巢组织，引发卵巢早衰。研究发现，约有10%~20%的卵巢早衰患者合并有自身免疫性甲状腺疾病。其他自身免疫病： 像类风湿关节炎等自身免疫性疾病，其免疫系统的异常激活，也可能对卵巢造成损伤，导致卵巢功能提前衰退。
医源性因素所致
手术影响： 例如卵巢切除术，若因疾病等原因进行了双侧卵巢切除，必然会导致卵巢功能丧失，引发早衰。另外，盆腔的恶性肿瘤手术，如宫颈癌、子宫内膜癌等的根治术，在切除肿瘤的过程中可能会损伤卵巢的血液供应或直接破坏卵巢组织，从而引起卵巢早衰。放疗化疗： 女性接受腹部或盆腔的放疗，如用于治疗恶性肿瘤时，射线会破坏卵巢内的卵泡，影响卵巢功能；一些化疗药物，像环磷酰胺等，也可能对卵巢细胞产生毒性作用，导致卵泡凋亡，进而出现卵巢早衰。通常在化疗后1~2年可能会出现卵巢功能减退的表现。