甲状腺肿大的原因有多种。一般来说，碘缺乏是常见原因之一，当人体长期处于碘摄入不足状态时，比如一些远离海洋且不经常吃含碘丰富食物的地区人群，就容易因碘缺乏引发甲状腺肿大。
碘相关因素引起
碘缺乏： 人体合成甲状腺激素需要碘，如果饮食中长期缺碘，甲状腺就会代偿性肿大来试图合成更多激素。例如一些山区由于土壤中碘含量低，当地居民长期碘摄入不足，甲状腺肿大患病率相对较高。碘过量： 虽然碘缺乏会导致甲状腺肿大，但碘摄入过量也可能引发。比如长期大量服用含碘药物，像胺碘酮等，就可能干扰甲状腺正常的激素合成与代谢，从而引起甲状腺肿大。
自身免疫因素导致
自身免疫性甲状腺炎： 像桥本甲状腺炎就是常见的自身免疫性甲状腺疾病，患者体内会产生攻击甲状腺组织的自身抗体，导致甲状腺组织被破坏、增生，进而引起甲状腺肿大。这种疾病可发生在各个年龄段人群中。Graves病： 这也是一种自身免疫性疾病，患者体内的促甲状腺激素受体抗体刺激甲状腺细胞增生，使得甲状腺肿大，同时还常伴有甲状腺功能亢进的表现，如心慌、手抖、多汗等。
药物及其他物质影响
某些药物： 一些药物可能会影响甲状腺功能导致肿大。比如锂剂，长期服用锂剂的患者，有一定概率出现甲状腺肿大的不良反应。致甲状腺肿物质： 某些食物或物质也可能引起甲状腺肿大。例如木薯中含有氰化物，在体内代谢后可能影响甲状腺对碘的利用；卷心菜、大豆等食物长期大量食用，也可能干扰甲状腺激素的合成，引发甲状腺肿大。