美尼尔综合症确切病因目前尚未完全明确，一般认为可能与内耳膜迷路积水有关，有研究显示其发病可能与以下几方面因素相关。
内淋巴产生和吸收失衡
内淋巴产生过多： 内淋巴由耳蜗血管纹产生，如果血管纹功能异常，就可能导致内淋巴产生过多。比如有研究发现，部分美尼尔综合症患者存在血管纹细胞钠 - 钾 - ATP酶功能障碍，使得内淋巴生成增多。内淋巴吸收障碍： 内淋巴通过内淋巴囊吸收，如果内淋巴囊的吸收功能出现问题，也会引起内淋巴积水。例如内淋巴囊上皮细胞的分泌、重吸收功能异常时，就无法正常吸收内淋巴，从而导致膜迷路积水。
免疫反应因素
自身免疫反应： 有证据表明，美尼尔综合症可能与自身免疫反应有关。部分患者体内存在自身抗体，这些抗体可能攻击内耳组织，影响内耳的正常结构和功能，进而引发美尼尔综合症。比如在一些患者的血清中可检测到针对内耳组织的特异性抗体，这些抗体可能导致内耳毛细胞、支持细胞等受损，影响内耳的平衡和听觉功能。过敏反应： 过敏体质的人更容易发生美尼尔综合症。当接触到过敏原时，身体会发生过敏反应，引起内耳毛细血管扩张，通透性增加，导致内淋巴产生过多或吸收障碍，最终引发美尼尔综合症的发作。例如对食物、药物、花粉等过敏的人，在接触过敏原后，可能出现美尼尔综合症的相关症状。
遗传因素
家族遗传倾向： 美尼尔综合症具有一定的遗传倾向。有研究发现，约10% - 30%的美尼尔综合症患者有家族史。如果家族中有美尼尔综合症患者，那么其他家庭成员患该病的风险可能会增加。不过，目前尚未明确具体的致病基因，但遗传因素在其发病中起到了一定作用。比如一个家庭中如果父母一方患有美尼尔综合症，其子女患该病的概率比普通人群要高一些。基因易感性： 某些基因的多态性可能与美尼尔综合症的易感性相关。不同的基因可能影响内耳的结构、功能以及身体的免疫反应等，从而使个体更容易发生美尼尔综合症。例如一些与内耳离子通道、免疫调节相关的基因发生突变或多态性改变时，就可能增加患美尼尔综合症的风险。
其他因素
病毒感染： 病毒感染可能与美尼尔综合症的发生有关。例如腮腺炎病毒、麻疹病毒、疱疹病毒等感染可能影响内耳，引发免疫反应，导致内耳损伤，进而诱发美尼尔综合症。有研究报道，部分美尼尔综合症患者在发病前有病毒感染的病史。精神心理因素： 长期的精神紧张、焦虑、抑郁等精神心理因素也可能诱发美尼尔综合症。精神心理因素会影响自主神经功能，进而影响内耳的血液循环和内淋巴的代谢。比如长期处于高压力工作状态下的人，患美尼尔综合症的几率可能相对较高。当精神压力过大时，体内的激素水平会发生变化，影响内耳的正常生理功能，导致膜迷路积水等情况出现，从而引发美尼尔综合症的发作。