尿道口痛可能由多种原因引起，比如尿道炎，大约50%的尿道炎患者会出现尿道口痛的症状。
尿道炎导致的尿道口痛
淋菌性尿道炎：由淋病奈瑟菌感染引起，除了尿道口痛，还会有尿道脓性分泌物，多在不洁性生活后1~10天出现症状。非淋菌性尿道炎：主要由衣原体或支原体感染所致，尿道口痛相对较轻，可能有尿道刺痒、少量稀薄分泌物等表现，发病时间一般在不洁性生活后1~3周。
外伤引起的尿道口痛
外力撞击：如果会阴部受到外力撞击，比如骑跨伤等，会直接导致尿道口局部损伤，出现疼痛，受伤当时可能就会感觉尿道口痛，还可能伴有局部肿胀等情况。医源性损伤：比如尿道器械检查时操作不当，也可能损伤尿道口，引起疼痛，通常检查后短时间内就会有尿道口痛的感觉。
泌尿系统结石引发的尿道口痛
尿道结石：当尿道内有结石时，结石会刺激尿道黏膜，导致尿道口痛，同时可能伴有排尿困难、尿线变细等症状，结石位置不同，疼痛表现可能有差异。膀胱结石：膀胱结石移动时可能会刺激尿道内口，也会引起尿道口痛，还可能出现排尿中断等典型症状。