肾阳虚多由多种因素引起，比如年高肾亏，随着年龄增长，人体的肾脏功能会逐渐衰退，50岁以上人群相对更易出现肾阳虚；还有久病伤肾，像一些慢性疾病若长期不愈，会损伤肾脏阳气，病程超过3个月的慢性疾病患者需留意肾阳虚风险；以及房劳过度，性生活无节制，一年内性生活频率超过正常范围（正常成年人性生活频率一般每周1~2次，超过这个频率且长期如此）也可能导致肾阳虚。
先天禀赋不足引起
父母体质虚弱： 如果父母在备孕时自身肾阳就不足，那么遗传给子女的先天禀赋就可能较差，子女从出生起就相对更容易出现肾阳虚的情况。比如父母一方有长期畏寒怕冷、腰膝酸软等肾阳不足的表现，其子女发生肾阳虚的概率比父母体质良好的子女要高一些。早产或低体重： 早产儿或者低体重儿由于在母体内发育不够成熟，出生后机体的肾阳根基相对薄弱，日后更容易出现肾阳虚的症状。有研究显示，早产儿中出现肾阳虚相关表现的比例比足月儿高出约20%。
外邪侵袭导致
寒湿之邪久居： 长期处于寒冷潮湿的环境中，比如长期在阴暗潮湿的地下室工作或生活，寒湿之邪容易侵袭人体，损伤肾阳。连续3个月以上处于湿度大于70%、温度低于10℃的环境中，患肾阳虚的风险会明显增加。风寒之邪侵袭后未及时调理： 当人体被风寒之邪侵袭后，如果没有得到及时有效的调理，风寒之邪可能会深入体内损伤肾阳。比如在寒冷季节受风寒后，没有及时添加衣物、采取保暖措施，风寒之邪滞留体内，时间超过2周仍未恢复，就可能影响肾阳功能。
过度劳累损伤
体力劳动过度： 长期从事重体力劳动，身体消耗过大，容易损伤肾阳。像一些建筑工人，每天从事高强度体力劳动，工作时间超过8小时且持续1年以上，出现肾阳虚的几率较高。脑力劳动过度： 长期高强度的脑力劳动，会耗伤人体的阳气，尤其是肾阳。比如长期伏案工作的IT人员，每天工作超过10小时，连续2年以上，可能会出现肾阳虚的表现，如精神萎靡、畏寒等。