肛门发痒可能由多种原因引起，比如约有50%的肛门瘙痒与局部皮肤病有关。
局部皮肤病变引起
肛周湿疹：这是常见原因之一，多因局部潮湿、摩擦、过敏等因素导致。患者肛周皮肤会出现红斑、丘疹、水疱等，伴有剧烈瘙痒，搔抓后可能糜烂、渗出。比如长期穿紧身不透气的内裤，就容易诱发肛周湿疹引起瘙痒。肛门尖锐湿疣：由人乳头瘤病毒（HPV）感染所致，病变多发生在肛门及肛周皮肤黏膜交界处，初期为淡红色小丘疹，逐渐增大增多，可呈菜花状、乳头状，常伴有瘙痒感。
寄生虫感染导致
蛲虫感染：多见于儿童，夜间雌虫会爬出肛门产卵，刺激肛周皮肤，引起剧烈瘙痒，尤其以夜间明显。可以在夜间孩子入睡后1-3小时检查肛周，常能发现白色细小的蛲虫。蛔虫、绦虫等肠道寄生虫：当肠道内有这些寄生虫时，也可能导致肛门瘙痒，一般是因为寄生虫的代谢产物或虫体移动刺激肛门周围。
肛肠疾病引发
痔疮：尤其是外痔，痔核脱出肛门外，会刺激肛周皮肤，导致分泌物增多，进而引起瘙痒。如果痔疮出现炎症、水肿，瘙痒会更明显。肛瘘：肛瘘外口会持续流出少量脓性、血性、黏液性分泌物，这些分泌物刺激肛周皮肤，就会引起瘙痒，有时还会伴有肛周潮湿、疼痛等症状。
全身性疾病相关
糖尿病：糖尿病患者血糖控制不佳时，尿液中含糖量升高，会刺激肛周皮肤，容易引发瘙痒。同时，糖尿病患者免疫力相对较低，也更容易发生皮肤感染，加重瘙痒。肝胆疾病：像肝硬化、胆汁淤积症等肝胆疾病患者，由于血液中胆盐含量升高，会刺激皮肤神经末梢，导致全身皮肤瘙痒，也可能累及肛周皮肤。