肛门瘙痒可能由多种原因引起。据相关医学研究，约60%的肛门瘙痒与局部因素有关，另外40%可能与全身性疾病等相关。
局部皮肤因素
卫生问题：不注意肛门局部清洁，比如每天排便后没有及时清洗肛门，粪便残渣等刺激肛门皮肤，就容易引发瘙痒。特别是一些老年人行动不便，清洁不及时更易出现这种情况。肛周皮肤病：像湿疹就是常见的导致肛门瘙痒的皮肤病。肛周湿疹会使局部皮肤出现红斑、丘疹、水疱等改变，伴有剧烈瘙痒，而且搔抓后可能会渗出、结痂。另外，股癣也可能波及肛周，引起瘙痒，它是由真菌感染引起的，会在肛周出现环状的红斑，边缘有丘疹、水疱等。
肛肠疾病因素
痔疮：尤其是内痔脱出时，会导致直肠分泌物溢出肛门外，刺激肛门周围皮肤，引发瘙痒。据统计，有痔疮的患者中约有30%会出现不同程度的肛门瘙痒症状。肛瘘：肛瘘外口会持续有脓性、血性、黏液性分泌物排出，这些分泌物刺激肛门周围皮肤，就会造成瘙痒。肛瘘患者的肛门周围经常能看到外口，有分泌物不断流出。肛裂：肛裂患者排便时会有剧烈疼痛，同时裂口处的分泌物也会刺激肛门皮肤，引起瘙痒。
全身性疾病因素
糖尿病：糖尿病患者血糖控制不佳时，尿液中含糖量增高，会刺激肛门皮肤，容易引发瘙痒。据临床观察，约10%的糖尿病患者会出现肛门瘙痒的症状。肝胆疾病：像黄疸患者，由于血液中胆盐含量升高，会沉积在皮肤下刺激神经末梢，导致全身皮肤瘙痒，也可能累及肛门周围皮肤引起瘙痒。寄生虫感染：尤其是蛲虫感染，多见于儿童。蛲虫在夜间会爬到肛门周围产卵，刺激肛门皮肤，引起剧烈瘙痒，尤其是夜间更为明显。