孕妇有甲减对胎儿是有影响的。研究表明，孕妇甲减可能使胎儿智力发育受影响，增加早产、流产等风险，大概有5% - 10%的胎儿可能因母体甲减出现神经智力发育受损情况。
对胎儿智力发育的影响
早期影响： 怀孕前3个月是胎儿神经系统发育关键期，若孕妇甲减，甲状腺激素分泌不足，会阻碍胎儿神经细胞发育。有数据显示，孕妇甲减未控制时，胎儿出生后智力发育商数（DQ）可能比正常孕妇所生胎儿低7 - 8分。长期影响： 即使出生后甲状腺功能恢复正常，甲减孕妇所生儿童在学龄期仍可能出现学习能力下降，尤其是数学计算和语言表达方面相对较弱。
对胎儿生长发育的影响
生长迟缓风险： 甲状腺激素对胎儿生长发育中的骨骼生长、器官发育等起重要调节作用。孕妇甲减时，胎儿生长速度可能减慢，出生体重低于正常胎儿的概率增加，有研究发现约15%的甲减孕妇所生胎儿出生体重低于2500克。器官发育异常： 可能影响胎儿心脏、肾脏等重要器官的正常发育，导致心脏结构异常概率升高，肾脏的滤过功能等也可能受一定影响。
增加妊娠并发症风险
早产风险升高： 孕妇甲减会使体内激素平衡紊乱，增加早产发生的可能性。临床统计显示，甲减孕妇早产发生率比正常孕妇高约20%。流产风险增加： 甲状腺功能异常会干扰胎盘的正常功能，使得流产风险明显增加，大约有10% - 15%的甲减孕妇会发生流产。