一、生理性原因
（一）月经前后
月经来潮前或结束后的1-2天，可能会有少量褐色分泌物排出，这是因为少量子宫内膜脱落，与阴道酸性环境作用后颜色变为褐色，一般没有其他不适症状，这是正常的生理现象，与年龄、性别等因素关系不大，主要是激素水平变化导致子宫内膜少量剥脱引起。
（二）排卵期出血
部分女性在排卵期，由于雌激素水平短暂下降，子宫内膜失去雌激素的支持，出现少量脱落，从而导致阴道流出褐色的东西，一般出血量较少，持续时间短，可能伴有轻微腹痛，这种情况在有生育年龄的女性中较为常见，与女性自身激素波动有关。
二、病理性原因
（一）妇科炎症
阴道炎：如细菌性阴道炎、霉菌性阴道炎等，炎症刺激阴道黏膜，导致黏膜充血、少量出血，与阴道分泌物混合后可表现为褐色分泌物，同时可能伴有阴道瘙痒、分泌物异味等症状。不同年龄女性都可能发生，性生活不卫生、局部卫生不良等是常见诱因。
宫颈炎：宫颈受到病原体感染等因素影响，宫颈黏膜充血、水肿，容易出现接触性出血或阴道不规则少量出血，表现为褐色分泌物，可伴有白带增多、性交痛等症状，育龄女性相对多见，与分娩、流产等导致宫颈损伤后易受感染有关。
（二）妇科肿瘤
子宫肌瘤：尤其是黏膜下子宫肌瘤，会影响子宫收缩，导致子宫内膜面积增大，引起阴道不规则出血，可表现为褐色分泌物，还可能伴有月经量增多、经期延长等症状，多见于30-50岁女性，与雌激素水平过高、遗传等因素有关。
宫颈癌：早期可能出现接触性出血，如性生活后或妇科检查后少量出血，血液在阴道内停留时间较长时可变为褐色分泌物，随着病情进展，还可能出现阴道不规则流血、阴道排液等症状，好发于有多个性伴侣、性生活过早、HPV感染等情况的女性，各生育年龄女性均可发病。
（三）内分泌失调
长期熬夜、精神压力大等因素可导致内分泌失调，引起激素水平紊乱，影响子宫内膜的正常生长和脱落，出现阴道褐色分泌物，这种情况在有不良生活方式的女性中较为常见，不同年龄女性都可能发生，主要是生活方式改变影响了下丘脑-垂体-卵巢轴的功能。
（四）其他
宫内节育器影响：部分女性放置宫内节育器后，可能出现阴道不规则少量出血，表现为褐色分泌物，一般在放置节育器后的前3-6个月较为常见，与节育器刺激子宫内膜有关，不同年龄放置节育器的女性都可能出现这种情况。