三个月不来月经且排除妊娠后，需针对病因进行治疗。可存在下丘脑性闭经、卵巢性闭经以及子宫性闭经这几种情况。
一、下丘脑性闭经：例如精神应激、体重下降、运动性闭经等。对此，患者要增强机体体质，给予充足的营养，让体重维持在标准水平。具体来说，精神应激可能源于生活中的各种压力事件，长时间的精神紧张会影响下丘脑的正常功能，导致闭经；而体重下降过多或过度运动，会使身体的能量供应失衡，也可能引发闭经。
二、卵巢性闭经：像是卵巢早衰、多囊卵巢综合征等。可采用性激素补充疗法，比如雌激素补充疗法、雌孕激素人工周期疗法等，这样能维持女性全身健康与生殖健康，促进和保持第二性征及月经。其中，卵巢早衰意味着卵巢功能过早衰退，不能正常分泌激素和排卵；多囊卵巢综合征则会使激素分泌紊乱，影响月经周期。
三、子宫性闭经：如果是宫颈狭窄或粘连，可实施宫腔镜下宫颈扩张治疗。这种情况主要是由于子宫颈出现问题导致月经不能正常流出。
总之，建议患者尽快到医院相关科室就诊，在专业医生指导下，完善相关检查，以明确疾病诊断，进而接受规范化的治疗。