一、感染风险增加
经期第三天时，女性的宫颈口处于相对开放状态，子宫内膜有创面，此时同房容易将外界的细菌等病原体带入阴道、宫颈甚至宫腔内，引发感染。例如，有研究表明，经期同房导致盆腔炎的风险会显著升高，盆腔炎可能会出现下腹部疼痛、阴道分泌物增多且有异味等症状，严重时还可能影响生育功能，对于有性生活的女性来说，无论是年轻还是年长的，都存在这样的感染风险，尤其是本身有妇科炎症病史的女性，风险更高。
二、月经异常
同房的刺激可能会导致子宫收缩，进而引起经血逆流。经血逆流可能会使子宫内膜碎片等种植在盆腔其他部位，增加子宫内膜异位症的发生几率。子宫内膜异位症常见的症状有继发性进行性加重的痛经、月经失调等，比如月经量增多、经期延长等情况，这对不同年龄阶段的女性都会产生影响，年轻女性若不注意，也可能为未来的生育等带来隐患。
三、对生殖系统健康的长期影响
从长期来看，频繁在经期同房可能会对生殖系统的健康造成持续损害。比如增加慢性盆腔疼痛的发生风险，影响女性的生活质量。对于有生育计划的女性，经期同房导致的盆腔炎、子宫内膜异位症等问题都可能干扰正常的受孕过程，降低受孕的几率。而对于已经生育过的女性，也可能因为这些问题出现身体不适等情况，影响日常生活和身体健康状况。
总之，经期第三天同房存在较多不良后果，无论是从短期的感染、月经异常，还是长期的生殖系统健康影响方面考虑，都不建议在经期同房，女性应该重视自身生殖健康，在经期避免性生活。