肛门痒痒的原因有多种，其中最常见的是局部皮肤问题，比如约70%的肛门瘙痒是由肛门周围皮肤疾病引起的。
局部皮肤疾病导致
肛周湿疹：这是比较常见的原因，多与过敏、局部潮湿等有关。患者肛门周围皮肤会出现红斑、丘疹，伴有剧烈瘙痒，搔抓后可能会有渗出、结痂等表现。比如长期穿不透气的内裤，局部长期处于潮湿环境，就容易引发肛周湿疹导致肛门痒。肛门周围真菌病：当肛门周围感染真菌时，也会出现瘙痒症状。像白色念珠菌感染，会使肛门周围皮肤出现潮红、脱屑等改变，并且瘙痒明显，尤其在夜间可能会加重。
寄生虫感染因素
蛲虫感染：多见于儿童，尤其是5 - 10岁的儿童。雌蛲虫会在夜间爬出肛门产卵，刺激肛门周围皮肤，引起剧烈瘙痒，尤其是夜间更明显，有时能在肛周看到白色细小的蛲虫。蛔虫等其他寄生虫：虽然相对蛲虫感染引起肛门痒的情况少一些，但如果肠道内有蛔虫等寄生虫，也可能偶尔会导致肛门瘙痒，不过这种情况相对少见。
肛肠疾病影响
痔疮：患有痔疮时，尤其是内痔脱出或外痔肿胀，会导致肛门周围分泌物增多，刺激肛门皮肤引起瘙痒。比如Ⅱ度以上的内痔，容易脱出肛门外，就可能伴随肛门瘙痒症状。肛瘘：肛瘘外口会持续有脓性、血性、黏液性分泌物排出，这些分泌物刺激肛门周围皮肤，也会引起瘙痒。而且肛瘘反复发作，会让肛门周围皮肤处于潮湿、刺激的状态，加重瘙痒感。肛裂：肛裂患者因为肛门周围有裂口，排便时疼痛，同时也可能伴有分泌物，这些分泌物刺激肛门周围皮肤，导致瘙痒。比如慢性肛裂患者，肛门周围皮肤长期受到炎症刺激，瘙痒症状可能会比较顽固。