消化不良通常是由多种因素引起的，比如饮食方面，当人们短时间内进食过多油腻、辛辣或者难以消化的食物时，就容易出现消化不良，大约有10% - 30%的人会因为饮食不当引发偶尔的消化不良。
饮食因素导致的消化不良
暴饮暴食： 一次性摄入大量食物，超过了胃肠道的消化能力，例如一顿饭吃下平时两倍的食量，就可能让胃需要长时间去消化这些食物，从而引起腹胀、腹痛等消化不良症状。食物不耐受： 比如有些人对乳糖不耐受，喝了牛奶后，其中的乳糖无法被正常消化吸收，就会出现腹痛、腹泻、腹胀等消化不良表现；还有些人对某些特定食物蛋白过敏，进食后也会引发消化不良反应。
胃肠道疾病引发的消化不良
胃炎： 患有慢性胃炎的人，胃黏膜处于受损状态，其消化功能会受到影响，胃酸分泌可能异常，导致食物在胃内不能很好地被消化，常常出现上腹部隐痛、饱胀、嗳气等消化不良症状，据统计，约有20% - 30%的消化不良患者与胃炎相关。胃溃疡： 胃溃疡患者的胃黏膜有溃疡面，进食后，食物刺激溃疡部位，会影响胃的正常消化蠕动，容易出现餐后上腹部疼痛、反酸、恶心、呕吐等消化不良情况，而且病情容易反复。
精神心理因素造成的消化不良
长期压力大： 当人长期处于高压力状态下，比如工作压力大、生活负担重等，会影响植物神经功能，进而干扰胃肠道的正常蠕动和消化液分泌，大约有15% - 25%的消化不良与精神压力过大有关，常见表现为食欲不振、早饱、胃部不适等。焦虑抑郁情绪： 患有焦虑症或抑郁症的人，胃肠道功能会出现紊乱，导致消化不良。因为情绪问题会影响神经递质对胃肠道的调节，使得消化过程受到干扰，出现消化不良伴随情绪不佳的双重症状。