肾综合征出血热主要分为发热期、低血压休克期、少尿期、多尿期和恢复期，不同阶段症状不同。一般来说，发病早期会有发热等表现。
发热期症状：
发热表现： 起病急，体温多在39~40℃之间，发热持续时间一般为3~7天。同时可能伴有全身中毒症状，如头痛、腰痛、眼眶痛，也就是“三痛”症状。还会有胃肠道症状，比如恶心、呕吐、腹痛、腹泻等。毛细血管损伤表现： 发病2~3天左右，患者可能出现球结膜充血、水肿，皮肤会有出血点，常见于胸背部、腋下等部位，呈搔抓样、条索状出血点。
低血压休克期症状：
血压下降： 一般在发热末期或热退同时出现血压下降。患者会感觉头晕、心慌、口渴、烦躁不安等。如果休克得不到及时纠正，可能会出现发绀、尿量减少等情况。重要脏器灌注不足表现： 肾脏灌注不足会导致尿量进一步减少；脑灌注不足可能引起神志恍惚、谵妄等表现；心脏灌注不足可能出现心率加快等。
少尿期症状：
尿量减少： 24小时尿量少于400ml为少尿，少于50ml为无尿。此时患者会出现尿毒症、酸中毒和水电解质紊乱。表现为厌食、恶心、呕吐、腹胀、腹泻等胃肠道症状加重，还可能有头晕、头痛、烦躁、嗜睡甚至昏迷、抽搐等神经系统症状，以及出血倾向加重，比如皮肤瘀斑增多、鼻出血、牙龈出血等。
多尿期症状：
尿量增多： 随着肾功能逐渐恢复，尿量开始增多，24小时尿量可达2000ml以上，多尿初期氮质血症可能继续加重，后期才逐渐改善。此期患者如果补液不当，可能会出现脱水及电解质紊乱，如低钾血症、低钠血症等，表现为全身乏力、心悸、恶心等。
恢复期症状：
体力恢复： 经过多尿期后，尿量逐渐恢复正常，患者一般情况好转，体力开始恢复。但仍可能有乏力、多汗、食欲缺乏等表现，不过多数患者在1~3个月后可基本恢复。部分患者可能会遗留高血压、肾功能减退、心肌劳损等后遗症。