药物流产后做清宫手术会有疼痛。具体如下：
一、在手术过程中，器械进入宫腔，器械刺激以及子宫收缩均会让患者感到明显疼痛。所以对于非常怕痛的患者，若条件允许，可选择做无痛清宫。无痛清宫会进行麻醉，使患者在手术期间处于全麻状态，对疼痛无感知，能最大程度减轻疼痛感觉，减少患者痛苦，也利于医生更好操作。
1.清宫手术所使用的器械类似长柄勺子，深入子宫将残留物刮出。清宫术前一定要做B超。术前会比较痛苦，但现在可采用静脉麻醉。做清宫一定要去正规医院。
(1)药流术后因服用了米非司酮、米索前列醇，宫颈已软化，所以疼痛比普通人工流产会有所减轻。
(2)在不正规医院可能会特别疼，一些没经验的医生若用力过猛可能会穿透子宫，会带来极大疼痛，所以务必在正规医院进行。
尾段总结：总之，药物流产后清宫会疼，怕痛可选择无痛清宫，且一定要选择正规医院进行清宫手术，以减少痛苦和风险。