5岁宝宝睡觉磨牙的原因及处理方式如下：
一、牙龈炎及龋齿：这是较为常见的原因。宝宝可能会出现牙龈疼痛、食欲下降等情况。此时应及时带宝宝去医院，医生一般会根据具体情况适当进行抗感染治疗等，比如使用头孢克洛等药物，这样能明显改善症状。
二、微量元素缺乏：特别是钙、铁的缺乏。通常会伴有生长发育落后、多汗、腿疼以及贫血、注意力不集中等表现。建议完善钙离子、游离铁以及铁蛋白等相关检查来明确。一旦确诊，要及时补充钙元素和铁元素，比如让宝宝多喝牛奶、多吃动物性食物以及动物内脏等，这有利于促进症状的改善。
三、肠道寄生虫感染：尤其与蛔虫、饶虫等有关。一般会有消瘦、食欲下降以及腹痛等伴随症状。这种情况下需要及时进行驱虫处理，例如使用阿苯达唑等药物。
总之，当发现5岁宝宝睡觉磨牙时，要注意查找原因并采取相应的处理措施，以保障宝宝的健康。