事后紧急避孕药可能会带来一些坏处，比如约10% - 20%的人服用后会出现月经紊乱，可能导致月经提前或推迟。
月经方面的影响：
月经提前： 服用事后紧急避孕药后，体内激素水平发生变化，可能打乱正常的月经周期，使月经提前到来。一般来说，这种提前可能会持续1 - 2个周期，但具体情况因人而异。月经推迟： 也有不少人会出现月经推迟的情况，如果月经推迟超过1周，就需要警惕是否怀孕，同时也可能是药物影响了内分泌导致月经紊乱。
肠胃不适方面：
恶心呕吐： 大约有5% - 10%的人服用事后紧急避孕药后会出现恶心的症状，有的还会伴随呕吐。通常在服药后的几小时内出现，一般症状较轻，持续时间较短，但也有个别人症状比较严重。肠胃不适： 除了恶心呕吐，还可能出现肠胃不适，比如腹痛、腹泻等情况，这是因为药物对胃肠道产生了一定的刺激作用。
其他可能的影响：
不规则阴道出血： 部分人在服用事后紧急避孕药后会出现不规则阴道出血的情况，出血量一般较少，但也有少数人出血量较多，类似少量月经。这种出血可能会持续几天，对生活有一定影响。影响后续避孕效果： 事后紧急避孕药不能作为常规避孕方法，频繁使用会影响后续正常的避孕效果，而且多次服用可能会使避孕失败的几率增加，同时也会进一步扰乱内分泌系统。