结石形成的原因有多种，比如肾结石，一般来说，尿液中某些物质浓度过高是关键因素。当尿液中钙、草酸、尿酸等成分含量超出正常范围，就容易形成结石。
一、代谢异常导致结石
尿液成分改变： 例如尿钙排泄增加，当血液中钙的浓度升高，经过肾脏过滤后，尿液中钙的含量就会增多，超过尿液的溶解度时，钙就可能结晶析出形成结石。像原发性甲状旁腺功能亢进患者，就会出现高钙血症，进而增加肾结石的形成风险。尿酸代谢异常： 体内尿酸生成过多或者尿酸排泄减少，都会使尿液中尿酸浓度升高。当尿酸饱和度超过一定程度，尿酸就会结晶沉淀，引发尿酸结石。比如一些喜欢吃高嘌呤食物（如动物内脏、海鲜等）的人，尿酸生成增多，就容易长尿酸结石。
二、局部因素引发结石
尿路梗阻： 当泌尿系统存在狭窄、肿瘤等情况时，尿液排出受阻，尿液在局部潴留，一些物质就容易沉积形成结石。比如输尿管狭窄的患者，尿液通过不畅，就为结石形成创造了条件。尿路感染： 细菌、感染产物等会作为核心，使尿液中的矿物质围绕其沉积形成结石。例如变形杆菌感染时，细菌产生的尿素酶会分解尿液中的尿素，使尿液碱化，促使磷酸镁铵等结晶形成结石。
三、生活方式相关因素
饮水不足： 每天饮水量少于1500毫升时，尿液会浓缩，导致尿液中各种矿物质的浓度相对升高，容易形成结石。建议每天饮水量保持在2000 - 3000毫升以上，以稀释尿液，降低结石形成风险。饮食不合理： 高草酸饮食是形成草酸钙结石的重要因素，像菠菜、苋菜、巧克力、坚果等食物中草酸含量较高，长期大量食用会增加草酸钙结石的发病几率。高嘌呤饮食除了影响尿酸代谢外，也与结石形成有关，长期摄入高嘌呤食物会使尿酸生成增多，增加尿酸结石风险。