耳结石主要是由于外耳道耵聍腺分泌的耵聍积聚过多，形成团块所致。耵聍是外耳道的正常分泌物，通常会随着下颌运动等自行排出，但如果耵聍分泌过多或排出受阻，就会逐渐积聚形成耳结石。
耵聍分泌过多导致
有些人耵聍腺分泌较为旺盛，产生的耵聍量远超正常排出速度，使得耵聍不断积累，进而形成耳结石。比如长期处于灰尘较多环境中的人，耵聍接触灰尘等异物后更易积聚。
耵聍排出受阻引发
外耳道狭窄、畸形、有异物等情况会阻碍耵聍排出。例如外耳道有炎症时，组织肿胀可能堵塞耵聍排出通道，导致耵聍无法正常排出而积聚成石。老年人肌肉松弛，外耳道皮肤弹性降低，也可能影响耵聍排出，增加耳结石形成风险。
不良挖耳习惯影响
经常用尖锐工具挖耳，容易损伤外耳道皮肤，引起外耳道炎症，同时还可能将耵聍推向深处，使耵聍更难排出，长期如此就容易形成耳结石。儿童如果被家长不当挖耳，也可能导致耵聍积聚问题。
疾病因素作用
一些耳部疾病也可能与耳结石形成有关，比如外耳道炎、湿疹等疾病会改变外耳道的正常环境和耵聍的排出过程，促使耳结石形成。有相关耳部疾病史的人群需要更加留意耳部状况，预防耳结石产生。