三叉神经痛是一种常见的脑神经疾病，其发病原因较为复杂。目前认为，约90%的原发性三叉神经痛是由于三叉神经根部受到血管压迫所致，比如小脑上动脉及其分支压迫三叉神经根。
血管压迫因素：
血管压迫机制：随着年龄增长，脑血管会发生退行性改变，血管弹性下降。当颅内的一些异常走行的血管，如小脑上动脉、小脑前下动脉等，长期压迫三叉神经根部，会导致神经纤维的髓鞘受损，使得神经冲动发生短路，从而引发疼痛。据统计，约有90%以上的原发性三叉神经痛是由这种血管压迫因素引起的。血管压迫的个体差异：不同个体血管压迫的程度和部位有所不同。有些人可能是单一血管压迫，而有些人可能是多根血管同时压迫三叉神经根部，这都会影响疼痛的发作频率和严重程度。
神经病变因素：
神经脱髓鞘改变：三叉神经感觉根或半月节发生脱髓鞘改变时，神经纤维之间的绝缘作用消失，导致神经冲动发生异常的传导。比如在一些炎症、外伤等因素影响下，神经髓鞘遭到破坏，正常的神经传导秩序被打乱，就容易引发三叉神经痛。神经短路现象：脱髓鞘的神经纤维之间，相邻的纤维之间会发生“短路”，当神经冲动传导时，这种短路会导致异常的神经冲动发放，进而触发三叉神经支配区域的剧烈疼痛。
其他少见因素：
肿瘤压迫：颅内的一些肿瘤，如听神经瘤、脑膜瘤、表皮样囊肿等，也可能压迫三叉神经，从而引起继发性三叉神经痛。不过这种情况相对较为少见，约占三叉神经痛病例的1%左右。肿瘤压迫导致三叉神经痛的机制是肿瘤组织直接压迫三叉神经，影响神经的正常功能，导致疼痛产生。先天性血管畸形：先天性的血管畸形也可能对三叉神经造成压迫或刺激，从而引发三叉神经痛。这种情况比较罕见，但也是导致三叉神经痛的原因之一。血管畸形会改变局部的血管分布和血流情况，进而影响三叉神经的正常生理功能。