子宫功能性出血通常是由内分泌失调、子宫内膜病变、全身性疾病等原因引起的。比如，青春期女性约有50%左右的功能性子宫出血是因为下丘脑-垂体-卵巢轴调节功能尚未完全成熟导致内分泌失调引发的；而一些患有血液系统疾病的患者，约有10% - 15%会并发子宫功能性出血。
内分泌失调因素
下丘脑-垂体-卵巢轴功能紊乱： 青春期女性下丘脑 - 垂体 - 卵巢轴调节功能尚未完全成熟，容易出现功能失调性子宫出血。比如，在月经初潮后的1 - 2年内，约有50%左右的功能性子宫出血是由此原因导致。而围绝经期女性，由于卵巢功能衰退，雌激素分泌减少，也会引起内分泌失调，进而引发子宫功能性出血。内分泌疾病影响： 像甲状腺功能亢进或减退，会影响激素的正常代谢，从而干扰子宫的正常出血调节。例如，甲状腺功能亢进患者，甲状腺激素分泌过多，会影响下丘脑 - 垂体 - 卵巢轴的功能，约有3% - 5%的患者会并发子宫功能性出血。
子宫内膜病变因素
子宫内膜息肉： 子宫内膜局部过度生长形成息肉，会导致子宫异常出血。一般通过妇科B超检查可发现，约有10% - 20%的子宫功能性出血患者是由子宫内膜息肉引起。息肉较小的时候可能没有明显症状，较大时就会影响子宫收缩，导致出血。子宫内膜癌： 多见于围绝经期及绝经后女性，子宫内膜癌会使子宫内膜异常增生，引起不规则阴道出血。据统计，约有5% - 8%的子宫功能性出血患者最终被确诊为子宫内膜癌。早期可能表现为少量阴道出血，随着病情进展，出血会增多。
全身性疾病因素
血液系统疾病： 如血小板减少性紫癜、白血病等，会影响凝血功能，导致子宫出血不易止住。约有10% - 15%的子宫功能性出血患者是因为血液系统疾病引起。例如，血小板减少性紫癜患者，由于血小板数量减少或功能异常，凝血功能障碍，就容易出现子宫功能性出血。肝脏疾病： 肝脏是多种激素代谢的场所，肝脏疾病会影响雌激素的灭活，导致体内雌激素水平升高，从而引起子宫功能性出血。约有2% - 4%的子宫功能性出血患者存在肝脏疾病相关因素。比如肝硬化患者，肝脏对雌激素的代谢功能减弱，会出现月经紊乱、子宫出血等表现。