男性泌尿系统感染通常由多种因素引起。一般来说，细菌感染是主要原因之一，比如大肠埃希菌等常见细菌可通过尿道逆行进入泌尿系统引发感染。
病原体感染因素
细菌感染： 最常见的是大肠埃希菌，约占尿路感染病原菌的80%左右。此外，变形杆菌、克雷伯菌等也可能导致男性泌尿系统感染。这些细菌会从尿道外口侵入，沿着尿道上行至膀胱、输尿管甚至肾脏，从而引发感染。支原体、衣原体感染： 不洁性行为可能导致支原体、衣原体感染泌尿系统，引发非淋菌性尿道炎等疾病，进而影响整个泌尿系统的健康。
自身泌尿系统结构与功能因素
尿路梗阻： 男性如果存在前列腺增生等情况，会导致尿路梗阻，尿液排出不畅，细菌容易在尿路中滋生繁殖，增加泌尿系统感染的风险。据统计，约50%的前列腺增生患者会合并泌尿系统感染。膀胱输尿管反流： 尿液从膀胱逆流至输尿管甚至肾盂，会将细菌带到泌尿系统的上部，容易引发感染。这种情况在一些先天性泌尿系统结构异常的男性中较为常见。
生活习惯因素
个人卫生不佳： 不注意私处清洁，会使细菌容易在尿道口滋生，进而侵入泌尿系统引发感染。尤其是包皮过长的男性，如果不经常清洗，更容易出现这种情况。饮水过少： 每天饮水量不足，会导致尿液生成减少，尿液对尿路的冲刷作用减弱，细菌容易在尿路中停留繁殖，增加感染几率。建议男性每天饮水量保持在1500~2000毫升以上。长期憋尿： 经常长时间憋尿，会使膀胱内压力增高，尿液逆流至输尿管的风险增加，同时尿液在膀胱内停留时间过长，有利于细菌生长繁殖，容易引发泌尿系统感染。