乳腺囊肿的形成原因主要与内分泌紊乱、乳腺结构不良以及哺乳相关因素有关。一般来说，内分泌紊乱是较为常见的诱因之一。
内分泌紊乱相关因素
激素失衡： 女性体内的雌激素和孕激素平衡失调时，容易引发乳腺囊肿。比如在月经周期中，雌激素水平短暂升高，若孕激素不能相应调整，就可能导致乳腺组织增生和囊肿形成。通常女性在30 - 50岁这个年龄段，内分泌相对不稳定，更易受激素失衡影响出现乳腺囊肿。长期精神压力： 长期处于高压力状态下，会影响内分泌系统的正常功能。压力会促使身体分泌过多的促肾上腺皮质激素，进而干扰雌激素与孕激素的正常调节，增加乳腺囊肿的发生风险。
乳腺结构不良因素
乳腺导管异常： 乳腺导管如果发生扩张、扭曲等异常情况，就可能导致分泌物潴留形成囊肿。例如乳腺导管的上皮细胞过度增生，会使导管堵塞，分泌物积聚，慢慢就形成了囊肿。腺叶结构问题： 乳腺的腺叶结构出现紊乱时，也可能引发囊肿。腺叶组织的排列、形态发生改变，影响了正常的乳腺组织功能，使得局部组织液积聚，形成囊肿。
哺乳相关因素
乳汁排出不畅： 在哺乳期，如果乳汁排出不顺畅，乳汁淤积在乳腺内，就容易形成囊肿。比如乳腺导管不通，乳汁无法顺利排出，就会在乳腺内积聚形成囊肿。一般初产妇在哺乳期更易出现乳汁排出不畅的情况，因为她们可能不太熟悉哺乳技巧，导致乳腺导管堵塞。乳腺炎症影响： 哺乳期发生乳腺炎症时，也可能伴随囊肿形成。炎症会影响乳腺组织的正常结构和功能，导致局部组织液异常积聚，形成囊肿。