慢性结肠炎可以使用的药物有多种，比如氨基水杨酸制剂，像柳氮磺吡啶，它是治疗轻、中度慢性结肠炎的常用药物之一，能在肠道内分解出5-氨基水杨酸，发挥抗炎作用。
氨基水杨酸制剂类药物
柳氮磺吡啶： 适用于轻、中度慢性结肠炎患者，通过在肠道内分解为5-氨基水杨酸来发挥抗炎作用，从而缓解腹泻、腹痛等症状。美沙拉嗪： 也是常见的氨基水杨酸制剂，有多种剂型，如缓释片、灌肠剂等，对于直肠和乙状结肠部位的慢性结肠炎效果较好，能局部作用于肠道炎症部位，减轻炎症反应。
糖皮质激素类药物
泼尼松： 对于氨基水杨酸制剂疗效不佳的中度及重度慢性结肠炎患者可考虑使用，它能快速减轻炎症反应，但长期使用可能会有较多副作用，如骨质疏松、免疫力下降等，所以需要在医生严格评估下使用。氢化可的松： 可用于病情较重的慢性结肠炎急性发作期，一般通过静脉给药等方式，能迅速缓解严重的炎症症状，但同样要注意其可能带来的不良反应。
免疫抑制剂类药物
硫唑嘌呤： 适用于对糖皮质激素治疗效果不佳或不耐受的慢性结肠炎患者，它可以抑制免疫系统的异常反应，起到调节免疫、控制炎症的作用，但用药过程中需要密切监测血常规等指标，因为可能会引起骨髓抑制等不良反应。巯嘌呤： 与硫唑嘌呤作用机制类似，也可用于慢性结肠炎的治疗，尤其适用于一些对其他药物反应不佳的患者，使用时也需要关注药物的副作用情况。
益生菌类药物
双歧杆菌四联活菌片： 可以调节肠道菌群，改善肠道微生态环境，对于慢性结肠炎患者肠道菌群失调的情况有一定的调节作用，有助于缓解腹泻等症状。枯草杆菌二联活菌颗粒： 同样能补充肠道有益菌，平衡肠道菌群，促进肠道功能恢复，对慢性结肠炎引起的肠道功能紊乱有一定的辅助治疗作用。