慢性结肠炎患者吃什么药能根治并不明确，因其病情和对药物反应各异，治疗效果也不同。临床上慢性结肠炎常用药有柳氮磺吡啶肠溶片、美沙拉嗪肠溶片、枯草杆菌二联活菌肠溶胶囊等。慢性结肠炎是多种原因致结肠慢性炎症的统称，原因包括细菌、真菌、病毒感染，遗传、免疫及放疗等，发病部位主要在结肠，也可累及直肠等。
一、柳氮磺吡啶肠溶片：为磺胺类抗菌药。
1.常用于溃疡性结肠炎、类风湿性关节炎。
二、美沙拉嗪肠溶片：临床用于溃疡性结肠炎、克罗恩病。
1.作用于炎症黏膜，可抑制引起炎症的前列腺素合成和炎症介质白三烯形成，对肠壁炎症有消炎作用。
三、枯草杆菌二联活菌肠溶胶囊：用于肠道菌群失调引起的腹泻、便秘、肠炎、腹胀、消化不良、食欲不振等。
1.可调节肠道菌群，辅助治疗慢性结肠炎。
此外，还可能用到盐酸莫西沙星片等药，具体用药需在医生指导下进行，不可盲目用药以免引发不良后果。
总之，慢性结肠炎的治疗药物应根据个体情况选择，患者应遵医嘱用药。