异常子宫出血的原因有多种。一般来说，内分泌失调是常见原因之一，比如青春期或围绝经期女性，由于下丘脑 - 垂体 - 卵巢轴的功能尚未完善或衰退，可能导致激素分泌紊乱，从而引起异常子宫出血。其中，青春期女性约有55% - 95%的异常子宫出血与排卵障碍有关。
内分泌失调相关原因
排卵障碍性异常子宫出血： 青春期女性下丘脑 - 垂体 - 卵巢轴调节功能尚未健全，促卵泡生成素（FSH）呈持续低水平，无促黄体生成素（LH）高峰形成，导致不排卵。围绝经期女性则是因为卵巢功能衰退，卵泡逐渐耗竭，对垂体促性腺激素反应低下，雌激素分泌量波动，不能形成排卵前高峰，引起无排卵性异常子宫出血。黄体功能异常： 黄体期孕激素分泌不足或黄体过早衰退，会使子宫内膜分泌反应不良和黄体期缩短。例如，育龄期女性若出现黄体功能不足，可能导致月经周期缩短，经前异常子宫出血。
器质性病变导致
子宫肌瘤： 是引起异常子宫出血较常见的器质性病变。肌壁间肌瘤会使子宫腔增大，子宫内膜面积增加并影响子宫收缩，黏膜下肌瘤则易导致子宫内膜表面积增大且内膜静脉充血、扩张，从而引起月经过多、经期延长等异常子宫出血表现。子宫内膜息肉： 子宫内膜局部过度生长形成息肉，息肉表面血管丰富，易发生破裂出血。患者常表现为经间期出血、月经过多、经期延长或不规则出血等。
全身性疾病影响
血液系统疾病： 如血小板减少性紫癜、白血病等，会影响凝血功能，导致异常子宫出血。血小板减少性紫癜患者体内血小板数量减少或功能异常，凝血机制受到影响，容易出现子宫出血不止的情况。甲状腺功能异常： 甲状腺功能亢进或减退都可能影响月经。甲状腺功能亢进时，甲状腺激素分泌过多，会干扰下丘脑 - 垂体 - 卵巢轴的功能，导致月经紊乱，出现异常子宫出血；甲状腺功能减退时，机体代谢率降低，也可能引起月经不调、经量异常等。