克罗恩病是一种慢性炎性肉芽肿性肠道疾病，常见症状较多。约10% - 20%的患者会出现腹痛，多为右下腹或脐周隐痛，有时呈痉挛性疼痛，进食后加重，排便或肛门排气后缓解。
肠道相关症状
腹泻： 多数患者有腹泻症状，排便次数因病变部位和病情轻重而异，可为每日数次至十余次不等。粪便多为糊状，一般无脓血和黏液，但病变累及结肠下段或肛门直肠时，可有黏液血便及里急后重感。腹部包块： 约10% - 20%的患者可出现腹部包块，多位于右下腹与脐周，因肠粘连、肠壁增厚、肠系膜淋巴结肿大、内瘘或局部脓肿形成所致。包块边界不清，有压痛。
全身表现
发热： 约30%的患者有间歇性低热或中等度发热，少数呈弛张高热伴毒血症。发热多与肠道炎症活动及继发感染有关。营养障碍： 因慢性腹泻、食欲减退及慢性消耗等，患者可出现消瘦、贫血、低蛋白血症和维生素缺乏等表现。儿童患者还可出现生长发育迟缓。
肠外表现
口腔黏膜溃疡： 约10% - 20%的患者可见口腔黏膜溃疡，表现为无痛性、浅表性的小溃疡。关节炎： 部分患者可出现外周关节炎，以大关节受累为主，呈非对称性、非侵蚀性，可伴有结节性红斑或坏疽性脓皮病等皮肤表现。眼部病变： 约5% - 20%的患者有虹膜炎、葡萄膜炎等眼部炎症，表现为眼痛、畏光、视力下降等。