膝盖窝囊肿通常指的是腘窝囊肿，其有时会与关节腔相通，可通过保守治疗或手术治疗来消除。若囊肿为1至2厘米，一般采用保守治疗，而当囊肿超过5厘米且有增大趋势时，则需手术治疗。
一、保守治疗：
1.若B超显示腘窝囊肿较小，仅1至2厘米，此时对机体影响不大，可进行保守治疗。要限制膝关节活动，减少活动量，同时可局部热敷来促进血液循环，以加速囊肿消退。
2.如果囊肿引发疼痛，可使用口服止痛药如布洛芬，也可外用药物如外敷如意金黄散，能起到消肿止痛的作用，有利于控制囊肿范围缩小。但药物的使用需在专业医生指导下进行，不可盲目选择，以免掩盖病情而不利于后续治疗。
3.若膝关节炎引发腘窝囊肿，且局部有渗出、积液并导致疼痛、肿胀，需在超声引导下进行穿刺抽出积液。
二、手术治疗：
1.当腘窝囊肿超过5厘米，并有进行性增大趋势，同时B超、核磁共振报告明确显示为囊肿时，可通过手术方式消除囊肿。
2.腘窝囊肿一般采取微创手术，可通过关节镜或微创切口来完整切除囊肿。在进行切除时，通常采用半身麻醉，即患侧腿部麻醉，要注意保护囊肿外壁的完整性，仔细分离囊肿与周围结构的关系，注意保护好神经、血管，将损伤降至最低，进行彻底切除，这对日后降低复发率有很大益处。
3.囊肿切除后通常需要2周左右愈合，然后可逐渐下地活动。在下地活动时也可佩戴护膝或用软的弹力绷带固定膝关节，以利于术后最终康复。
腘窝囊肿若不进行治疗，可能会压迫周围血管，导致小腿血流不畅，还会在做下蹲等动作时出现不便和疼痛症状，所以出现腘窝囊肿后要积极治疗，防止囊肿持续增大而导致病情加重。