胆总管囊肿一定要切除胆囊。原因如下：
一、胆囊充盈依靠胆道静水压作用。胆总管囊肿需将囊肿及相应胆道切除，切除后进行胆肠吻合术，术后胆道静水压消失，胆囊失去压力难以再充盈，胆汁无法存留，会导致胆囊萎缩，长期如此还可能引发癌变。
二、胆总管囊肿易引发胆囊癌。临床检测发现胆汁中胰液含量很高，通常胆总管囊肿存在临床变异，胰液会反流至胆道而非经过十二指肠乳头，这会刺激胆囊发生癌变。
总结：胆总管囊肿需切除胆囊主要是因为术后胆道静水压改变会使胆囊难以正常充盈且易发生病变，同时胆总管囊肿易引发胆囊癌，与胆汁中胰液反流刺激有关。