胆总管囊肿通常要切除胆囊，原因如下：首先，胆囊的充盈依赖于胆道静水压。而胆总管囊肿需将囊肿及相应胆道切除，之后进行胆肠吻合术，术后胆道静水压消失，胆囊失去压力而无法再充盈，胆汁也不会再存于胆囊中，时间长了胆囊会萎缩，且偶尔可能出现癌变。其次，胆总管囊肿容易引发胆囊癌，这是因为临床检测发现胆汁中胰液含量很高，一般胆总管囊肿存在临床变异，会使胰液不经过十二指肠乳头而反流至胆道，进而刺激胆囊发生癌变。
一、胆囊充盈与胆道静水压的关系：胆囊的正常充盈是由于胆道静水压的作用。
1.当胆总管囊肿出现时，需要将囊肿及其相应的胆道部分切除。
2.切除后进行胆肠吻合术，这会导致胆道静水压丧失。
二、胆囊的变化及后果：没有了胆道静水压，胆囊无法再被充盈，胆汁也不会在其中存在，会逐渐出现萎缩，长时间后可能出现癌变。
1.胆囊失去充盈能力后会慢慢萎缩。
2.存在发生癌变的风险。
三、胆总管囊肿与胆囊癌的关联：胆总管囊肿易引发胆囊癌。
1.胆汁中胰液含量高是常见现象。
2.因临床变异胰液反流至胆道，从而刺激胆囊发生癌变。
总之，胆总管囊肿患者通常需要切除胆囊，这是由于手术改变了胆道结构和压力，导致胆囊失去功能并可能出现不良后果，同时胆总管囊肿本身也与胆囊癌的发生存在一定关联。