月经性头痛是与月经周期相关的头痛，约有60%的女性偏头痛患者在月经期间会发作或加重，这主要与体内激素变化有关。
激素变化因素
雌激素波动： 在月经周期中，雌激素水平会发生明显变化。月经前期雌激素水平迅速下降，这可能会导致颅内外血管对5-羟色胺等血管活性物质的敏感性增加，从而引发头痛。研究发现，月经前雌激素水平的大幅波动是诱发月经性头痛的重要诱因之一。前列腺素影响： 月经期间，子宫内膜会合成并释放较多的前列腺素。前列腺素除了会引起子宫收缩外，还能影响脑血管，导致脑血管扩张或收缩功能紊乱，进而引发头痛。而且不同女性对前列腺素的敏感程度不同，敏感的女性更容易出现月经性头痛。
神经递质因素
5-羟色胺变化： 5-羟色胺是一种与头痛调节相关的神经递质。在月经周期中，5-羟色胺的水平会发生改变。当5-羟色胺水平降低时，会影响神经调节功能，使得头部的疼痛阈值降低，更容易出现头痛症状。例如，有研究表明，月经性头痛患者脑内的5-羟色胺代谢与正常女性存在差异。去甲肾上腺素变化： 去甲肾上腺素也参与了头痛的发生过程。月经期间去甲肾上腺素的分泌异常，会影响神经系统对疼痛的传导和调节，进而导致月经性头痛的出现。
个体差异因素
遗传因素： 如果家族中有女性成员有月经性头痛的病史，那么其他女性成员患月经性头痛的风险可能会增加。遗传因素可能通过影响个体的激素代谢、神经递质调节等方面，使个体更容易受到月经周期的影响而出现头痛。据统计，有家族遗传史的女性患月经性头痛的几率比无家族史的女性高出约3 - 5倍。生活方式因素： 长期的压力过大、睡眠不足、饮食不规律等生活方式因素也可能诱发或加重月经性头痛。比如，长期处于高压力状态下的女性，身体的内分泌和神经调节更容易出现紊乱，在月经期间就更易发生头痛；睡眠不足会影响身体的正常代谢和神经功能，也会增加月经性头痛的发生风险。