胎儿双肾盂分离不能判断胎儿性别。胎儿双肾盂分离与胎儿性别毫无关系，不论男孩还是女孩，在胎儿发育过程中都可能出现双肾盂分离现象，两者不存在必然联系，也不存在通过双肾盂分离判断胎儿性别的方法。孕期只有在有医学指征的情况下，才可以鉴别胎儿性别。若想知道胎儿是男孩还是女孩，可在怀孕16到20周时通过羊水穿刺检测胎儿染色体，这种方法准确率可达100%，但存在一定风险。此外，怀孕5个月后也可通过B超来辅助判断胎儿性别，但我国法律禁止鉴定胎儿性别。
一、胎儿双肾盂分离与性别无关：
1.不管是男胎还是女胎，在发育期间都可能有双肾盂分离的情况。
2.这说明双肾盂分离和胎儿性别之间没有必然的联系。
二、孕期性别鉴定的规定和方法：
1.只有医学指征才允许鉴别胎儿性别。
2.羊水穿刺检测胎儿染色体可在怀孕16到20周进行，准确率高但有风险。
3.怀孕5个月后可借助B超判断，但法律不允许进行胎儿性别鉴定。
总之，不能通过胎儿双肾盂分离来判断性别，且在我国孕期非医学需要的胎儿性别鉴定是不被允许的。