新生儿蚕豆病主要是由遗传因素导致的。这是一种X连锁不完全显性遗传疾病，由于葡萄糖-6-磷酸脱氢酶（G-6-PD）基因缺陷引起，大约有10%的新生儿蚕豆病患者是因为这种遗传因素发病。
遗传因素是主因
基因缺陷决定发病： 蚕豆病是因为G-6-PD基因发生突变，导致体内缺乏这种参与磷酸戊糖途径的酶。正常情况下，G-6-PD能维持红细胞内还原型谷胱甘肽（GSH）的含量，保护红细胞免受氧化物质的损伤。当基因缺陷时，红细胞就容易被氧化破坏，引发溶血等问题。家族遗传倾向明显： 如果家族中有蚕豆病患者，新生儿患蚕豆病的风险会增高。因为致病基因会通过遗传传递给下一代，男性发病多于女性，这是由于遗传方式是X连锁不完全显性遗传导致的性别差异。
环境因素诱发发病
食用蚕豆触发： 新生儿如果食用了蚕豆或接触到蚕豆花粉等，就可能诱发蚕豆病发作。一般在食用蚕豆后数小时至数天内会出现溶血症状，如面色苍白、黄疸等。接触氧化性物质刺激： 新生儿接触到樟脑丸、某些消毒剂（如含萘的卫生球）等氧化性强的物质时，也可能诱发溶血。这些氧化性物质会加速红细胞的氧化损伤，导致蚕豆病发作。
酶缺乏导致代谢异常
红细胞代谢受影响： G-6-PD缺乏使得红细胞的磷酸戊糖途径受阻，不能产生足够的NADPH来维持GSH的生成。红细胞内GSH减少后，对氧化剂的抵抗力下降，当遇到氧化性物质时，红细胞膜上的脂质、血红蛋白等容易被氧化，导致红细胞破裂，发生溶血。新生儿代谢特点加剧风险： 新生儿的代谢系统还不完善，对于氧化性物质的耐受能力比成人更弱。一旦接触到诱发因素，就更容易出现溶血等严重的临床表现，如血红蛋白尿、贫血加重等情况，需要及时就医处理。