治疗肠炎的药物有多种，常见的包括益生菌类药物、抗生素类药物等。比如益生菌类药物中的双歧杆菌三联活菌胶囊，能调节肠道菌群，一般可用于肠道菌群失调引起的肠炎等肠道疾病。
益生菌类药物
调节肠道菌群： 像双歧杆菌四联活菌片，它含有多种有益菌，可补充肠道有益菌群，抑制有害菌生长，对因肠道菌群紊乱导致的肠炎有一定调节作用。一般来说，儿童用药需在医生指导下根据体重等情况调整剂量。改善肠道功能： 枯草杆菌二联活菌颗粒，能促进肠道消化吸收，维持肠道正常生理功能，对于肠炎引起的消化功能紊乱有一定改善作用，婴儿等特殊人群使用时要遵循医生建议。
抗生素类药物
针对细菌感染性肠炎： 如果是细菌感染导致的肠炎，可能会用到左氧氟沙星片，但需要注意，18岁以下未成年人禁止使用左氧氟沙星，因为可能会影响骨骼发育。还有头孢克肟分散片，适用于敏感菌引起的肠炎等感染性疾病，不过对头孢类药物过敏者禁用。
止泻类药物
缓解腹泻症状： 蒙脱石散是比较常用的止泻药，它可以在肠道内形成保护膜，吸附肠道内的病菌和毒素，起到止泻作用。成人和儿童都可使用，但儿童使用时要注意剂量，按说明书或遵医嘱服用。比如儿童急性腹泻时，可将蒙脱石散用适量温水溶解后服用。减少肠道蠕动： 盐酸洛哌丁胺胶囊可用于控制急、慢性腹泻的症状，不过对于感染性腹泻，在使用时要谨慎，避免抑制肠道蠕动导致毒素吸收加重病情，孕妇和哺乳期妇女使用前需咨询医生。