三个月宝宝肚子咕噜咕噜响，可能有生理性原因，也可能有病理性原因，如消化不良、肠炎、肠梗阻等。
一、生理性原因：
肚子咕噜咕噜响通常考虑是肠鸣音。正常情况下，胃肠蠕动时本来就会出现肠鸣音。如果宝宝没有任何不舒服，肚子柔软，食欲良好，排气排便也正常，那就无需特殊处理。
二、消化不良：
1.三个月的小宝宝胃肠功能发育尚不完善。
(1)若是受凉或者喂养不规律，会加重肠胃负担，进而表现出消化吸收不好。
(2)肠道产气增多，就会使肠鸣音增多，同时还可能伴有食欲下降、大便次数增多以及奶瓣增多等情况。
三、肠炎：
1.小宝宝肠胃较为娇嫩，免疫力低下。
(1)如果不注意手卫生，或是喂奶用具没有及时消毒，又或者接触了患病的宝宝，都有可能被传染而导致肠炎。
(2)会有腹胀、肠鸣音增多、腹痛、哭闹以及大便异常等表现。
四、肠梗阻：
1.少数宝宝在胃肠炎发作期间可能会引发肠梗阻。
(1)或是由于大便干燥、粪块堵塞导致的肠梗阻。
(2)可能出现肠鸣音亢进或肠鸣音消失的情况，同时还会伴有排便、排气停止。
所以三个月的小宝宝肚子咕噜咕噜响不一定就是有问题，但如果伴随其他不适，就需要根据具体情况进行判断并对症治疗，应在医生指导下进行处理。
总结提示：三个月宝宝肚子响的原因多样，要仔细观察有无其他伴随症状，以便准确判断和处理。