脊柱炎的引起原因较为复杂，其中遗传因素是重要的一方面，约90%的强直性脊柱炎患者与人类白细胞抗原B27（HLA - B27）基因相关，HLA - B27阳性人群患强直性脊柱炎的风险比阴性人群高许多倍。
遗传因素相关
HLA - B27基因关联：研究发现，HLA - B27基因阳性者发生脊柱炎的概率明显高于阴性者。如果家族中有脊柱炎患者，那么家族其他成员中HLA - B27阳性者患脊柱炎的可能性会增加。
感染因素影响
肠道细菌感染：某些肠道细菌，比如肺炎克雷伯菌等，可能与脊柱炎的发生有关。当人体肠道受到这些细菌感染后，免疫系统可能会出现异常反应，错误地攻击自身组织，进而引发脊柱炎相关的炎症反应。泌尿生殖道感染：泌尿生殖道的一些病原体感染也可能参与脊柱炎的发病过程。例如，衣原体等病原体感染后，可能通过免疫交叉反应等机制，诱导脊柱炎的发生。
自身免疫紊乱所致
免疫系统异常激活：人体自身免疫系统出现紊乱时，免疫系统会错误地将自身的关节组织当作外来病原体进行攻击，导致关节部位发生炎症。在脊柱炎患者体内，能发现免疫系统相关的异常细胞和炎症因子参与了关节的炎症损伤过程，持续的炎症会逐渐破坏脊柱关节的结构和功能。环境因素作用：长期处于寒冷、潮湿的环境中，可能会增加脊柱炎的发病风险。另外，长期劳累、外伤等因素也可能在遗传易感性和免疫紊乱的基础上，诱发脊柱炎的发作。比如长期在阴冷潮湿工地工作的人群，相比生活在温暖干燥环境中的人群，患脊柱炎的几率相对更高一些。