急性肠炎的治疗方法主要有一般治疗、药物治疗等。一般来说，轻度急性肠炎通过调整饮食等一般措施可能在数天内缓解。
一般治疗方法
饮食调整： 发病初期应短暂禁食，之后可进食清淡、易消化的流质或半流质食物，如稀粥、面条等，避免食用辛辣、油腻、刺激性食物以及生冷食物，防止加重肠道负担。一般建议急性肠炎患者在急性期的12 - 24小时内先暂时禁食，之后逐步恢复饮食。休息调养： 患者要注意休息，保证充足的睡眠，让身体处于放松状态，有利于肠道功能的恢复。
药物治疗方面
抗感染药物： 如果是细菌感染引起的急性肠炎，可根据病情选用合适的抗生素，如诺氟沙星等，但诺氟沙星一般不建议18岁以下的人群使用，因为可能会影响软骨发育。对于病毒感染引起的急性肠炎，通常不需要使用抗病毒药物，主要是对症治疗。止泻药物： 若腹泻症状较为严重，可使用蒙脱石散等止泻药物。蒙脱石散可以在肠道内形成一层保护膜，吸附肠道内的毒素和病菌，起到止泻的作用。一般成人每次服用1袋（3克），每天3次。调节肠道菌群药物： 可以使用双歧杆菌四联活菌片等调节肠道菌群的药物，有助于恢复肠道正常的菌群平衡，改善肠道功能。比如双歧杆菌四联活菌片，一般来说，成人一次2 - 3片，一天3次。
对症支持治疗
补充水分和电解质： 急性肠炎患者由于腹泻、呕吐等症状，容易出现脱水和电解质紊乱的情况，需要及时补充水分和电解质。可以口服补液盐，成人补液盐III每袋溶于250毫升温开水中，根据脱水程度调整服用量，一般轻度脱水每天服用3000 - 4000毫升左右；也可以静脉输注葡萄糖盐水等溶液来补充水分和电解质，以维持体内水、电解质和酸碱平衡。