直肠粘膜脱垂的治疗需根据病情程度来定。一般来说，轻度直肠粘膜脱垂可以通过一些保守方法来改善，而中重度可能需要手术治疗。
保守治疗方法
一般治疗：
饮食调整： 患者应多吃富含膳食纤维的食物，如全麦面包、蔬菜、水果等，每天保证足够的水分摄入，一般建议每天饮水1500 - 2000毫升左右，这样能保持大便通畅，避免因便秘加重直肠粘膜脱垂。生活习惯改变： 避免长时间蹲厕所，排便时间最好控制在5分钟以内。同时，可进行提肛运动，每天早晚各进行一次，每次提肛30 - 50次，有助于增强肛门括约肌的功能。
药物治疗：
对于伴有炎症的直肠粘膜脱垂患者，可使用一些局部外用药物，如中药坐浴剂。中药坐浴可以改善局部血液循环，减轻炎症和水肿。常用的中药坐浴方有五倍子汤等，一般每天坐浴1 - 2次，每次15 - 20分钟。但药物治疗主要是辅助缓解症状，不能从根本上治愈直肠粘膜脱垂。
手术治疗情况
经肛门手术：
黏膜环切术： 适用于直肠粘膜脱垂较轻的患者。这种手术是通过环形切除脱垂的直肠粘膜，然后进行吻合，从而纠正脱垂情况。手术创伤相对较小，术后恢复较快，一般住院时间在5 - 7天左右。直肠黏膜折叠术： 通过折叠直肠粘膜，加强直肠的支持结构。该手术适用于部分直肠粘膜脱垂的患者，手术操作相对精准，能有效改善脱垂症状。
经腹手术：
直肠悬吊固定术： 对于较为严重的直肠粘膜脱垂患者，经腹手术中的直肠悬吊固定术是一种有效的治疗方式。它是将直肠固定在周围组织上，防止其再次脱垂。不过，经腹手术创伤相对较大，术后恢复时间较长，一般需要住院10 - 14天左右，且术后需要注意避免腹压增加的因素，如剧烈咳嗽、便秘等。