直肠粘膜脱垂的治疗方式需根据病情严重程度来定。一般来说，轻度直肠粘膜脱垂可先尝试非手术治疗，中重度可能需要手术干预。
非手术治疗为主
一般治疗：对于儿童直肠粘膜脱垂，多数可通过保守治疗自愈。比如孩子出现直肠粘膜脱垂时，要让孩子缩短排便时间，一般控制在5分钟以内，避免长时间蹲厕。同时，可让孩子进行提肛锻炼，每天做3 - 4次，每次10 - 15下，有助于增强肛门括约肌功能。对于成人轻度直肠粘膜脱垂，也要注意避免便秘和腹泻，保持大便通畅，多吃蔬菜水果，每天饮水量保持在1500 - 2000毫升左右，以防止大便干结加重脱垂。药物治疗：如果伴有肛门炎症等情况，可使用一些外用药物，如复方角菜酸酯乳膏等，能起到消肿、止痛、止痒的作用。但药物治疗主要是缓解伴随症状，不能从根本上治愈直肠粘膜脱垂。
手术治疗情况
经肛门手术：适用于直肠粘膜脱垂较严重但身体状况较差不能耐受复杂手术的患者。常见的有直肠粘膜环切术等，这种手术创伤相对较小，术后恢复相对较快。但术后仍需注意肛门护理，避免感染等并发症。经腹手术：对于病情较重、脱垂较为严重的患者，可能需要经腹手术。比如直肠悬吊固定术，通过将直肠固定在周围组织上，防止脱垂复发。不过经腹手术创伤相对大一些，术后恢复时间可能较长，一般需要1 - 2周左右住院观察恢复情况。
不同人群的治疗差异
儿童直肠粘膜脱垂：儿童直肠粘膜脱垂多与发育不完善有关，一般以非手术治疗为主。因为儿童身体还在发育中，手术可能会对其生长发育产生影响。随着孩子年龄增长，部分可自行痊愈。如果保守治疗一段时间后仍未改善，再考虑是否需要手术，但手术需非常谨慎。成人直肠粘膜脱垂：成人直肠粘膜脱垂一般非手术治疗效果有限，中重度脱垂通常需要手术治疗。但也要根据患者的身体状况、脱垂程度等综合评估。比如身体状况较差，有严重心脑血管疾病等基础病的成人患者，可能更倾向于选择创伤较小的经肛门手术；而身体状况较好的患者，经腹手术可能是更彻底的治疗方式。