细菌性痢疾主要靠抗生素治疗，常用的有喹诺酮类药物，如环丙沙星等，一般经过规范治疗，多数患者在1-2周内可逐渐康复。
抗生素选择原则
敏感抗生素为主： 医生通常会根据粪便细菌培养和药敏试验结果来选择敏感的抗生素。比如如果是志贺菌对某种抗生素敏感，就会选用该抗生素进行治疗。像对于成年患者，若没有喹诺酮类药物使用禁忌，可能会首选喹诺酮类抗生素。儿童用药需谨慎： 儿童患细菌性痢疾时，一般不首选喹诺酮类药物，因为可能影响骨骼发育。会选择头孢类等相对安全的抗生素，如头孢曲松等。
一般支持治疗
休息与隔离： 患者需要充分休息，发热、腹泻症状明显时应卧床休息。同时要进行消化道隔离，直至症状消失后1周，或连续2次粪便培养阴性。饮食调整： 急性期应给予易消化的流质或半流质饮食，如米汤、粥等。避免食用辛辣、油腻、刺激性食物，待病情好转后逐渐恢复正常饮食。
对症治疗
退热治疗： 当患者体温超过38.5℃时，可采用物理降温或药物降温。物理降温可选用温水擦浴等方法；药物降温可使用对乙酰氨基酚等退烧药，但要注意按照儿童或成人的不同剂量使用，儿童需根据体重计算用药量。补液治疗： 腹泻、发热可能导致脱水和电解质紊乱，需要及时补液。轻度脱水可口服补液盐，中重度脱水则需要静脉补液，补充丢失的水分和电解质，维持水、电解质和酸碱平衡。