40天婴儿发烧的处理方法包括物理退烧、药物退烧以及抗感染治疗。
一、物理退烧：若婴儿发烧温度不高，在38.5℃以下，主要采用物理降温法。1.可以用40℃左右的温水给婴儿擦浴全身，通过水分蒸发带走热量；2.适当减少患儿的衣物和被褥，避免捂热；3.敞开门窗保持通风，降低环境温度；4.使用专门的婴幼儿退烧贴，贴于额头等部位帮助降温。同时，要多给患儿喝水，促进其排尿，利于体温降低。
二、药物退烧：当患儿发烧温度较高，体温达到38.5℃以上时，则需要服用婴幼儿退烧药来退烧，比如对乙酰氨基酚混悬滴剂等。
三、抗感染治疗：若患儿发烧温度高且出现反复，退烧后又再次发烧，此时就需要及时去医院，查明是否存在病毒或细菌感染。如果是病毒性感染，可服用抗病毒药物；若是细菌性感染，则要服用头孢或阿莫西林等抗生素药物。总之，婴儿发烧后首先要给患儿测量体温，发烧温度在38.5℃以下，可优先采用擦浴、使用退烧贴、减少衣物等物理方法来降温，高于38.5℃则必须服用退烧药，对于反复发烧的患儿一定要及时就医，明确是否有感染。
总结提示：对于40天婴儿发烧，要根据体温情况选择合适的处理方法，物理降温是基础，高烧时需用药物退烧，反复发烧要警惕感染，及时就医诊断和治疗。