慢性咽炎并没有绝对“最好”的药，治疗需根据病情类型等选择。一般来说，常用药物有含漱液、含片等。比如复方硼砂含漱液，可用于清洁口腔、杀菌消炎，能在一定程度上缓解慢性咽炎症状，价格通常较为亲民，一般几元到十几元一瓶。
局部用药类
含漱液：常用的有复方硼砂含漱液，它能清洁口腔，抑制细菌生长，减轻咽部炎症。使用时需按一定比例稀释后含漱，每天可使用数次。还有呋喃西林溶液，也有杀菌、清洁咽部的作用，可缓解咽部不适。含片：如度米芬含片，能吸附在细菌表面，改变其通透性，从而发挥杀菌作用。西地碘含片则是利用所含碘分子的杀菌作用来减轻炎症。含片可直接作用于咽部患处，快速缓解咽部疼痛、干燥等症状，但使用时要注意按照说明书正确含服。
中成药类
清热解毒类：比如咽炎片，由玄参、天冬、牡丹皮等多种中药组成，具有养阴润肺、清热解毒、清利咽喉、镇咳止痒的功效，可用于慢性咽炎引起的咽干、咽痒、刺激性咳嗽等症状。一般一次吃5片，一日3次。还有板蓝根颗粒，有清热解毒、凉血利咽的作用，对慢性咽炎属风热证有一定的缓解效果，开水冲服，一次5 - 10克，一日3 - 4次。滋阴润燥类：像百合固金丸，由百合、地黄、熟地黄等组成，能养阴润肺、化痰止咳，适用于慢性咽炎属肺肾阴虚证，表现为咽干咽痛、干咳少痰等。一次6克，一日2次。
西药口服类
抗生素类：如果慢性咽炎是细菌感染引起，可使用抗生素。比如青霉素类的阿莫西林，不过使用前需确定患者不对青霉素过敏。但一般不轻易使用抗生素，只有明确有细菌感染证据时才考虑。还有头孢菌素类，如头孢拉定，同样要注意过敏情况。糖皮质激素类：在病情较严重、有明显水肿等情况时，可能会短期使用，如地塞米松等，但这类药物不能长期使用，需在医生严格评估下使用，因为长期使用可能会带来一些副作用，像引起血糖升高、骨质疏松等问题。