肠道功能紊乱的表现多样，比如约有20%-30%的人会出现腹痛症状，疼痛部位不固定，一般为隐痛或胀痛。
消化系统表现
腹痛： 多数患者有腹痛症状，疼痛程度不一，部位不固定，常见于脐周，一般在排便或排气后缓解。比如有的患者会每天固定时间出现腹痛，持续一段时间后可自行缓解。腹泻： 部分患者表现为腹泻，大便次数增多，可为稀便，每天可达3-5次甚至更多，有的患者晨起后会出现腹泻，称为晨起腹泻。而且腹泻可能会在进食后加重，比如进食油腻食物后容易诱发腹泻。便秘： 也有患者出现便秘情况，大便干结，排便困难，每周排便次数少于3次，有的患者数天才能排便一次，排便时感觉费力。
全身表现
精神症状： 肠道功能紊乱还可能引起全身精神方面的表现，约有50%左右的患者会出现焦虑、抑郁、失眠等症状。比如有的患者因为长期肠道不适，出现情绪低落、对事物缺乏兴趣，同时睡眠质量也受到影响，经常失眠多梦。疲劳乏力： 不少患者会有疲劳乏力的感觉，即使经过休息也难以缓解，影响日常生活和工作，约有40%的患者会出现这种情况，感觉浑身没劲，做一点事情就容易疲惫。
其他表现
消化不良： 患者常伴有消化不良的表现，食欲减退，进食少量食物就有饱腹感，还可能出现嗳气、反酸等症状，大约有30%的患者会有消化不良的情况，比如吃一点东西就觉得肚子胀，老是打嗝。肠鸣音异常： 有的患者能感觉到肠鸣音亢进或减弱，用听诊器可听到肠道蠕动的声音异常，比如肠鸣音亢进时，能明显听到肚子里咕噜咕噜的声音比较频繁。