肠道功能紊乱会出现多种症状。一般来说，肠道功能紊乱常见的症状表现多样。
消化方面的症状
腹痛： 患者可能会感到腹部隐痛或胀痛，疼痛部位不固定，有时在上腹部，有时在下腹部，疼痛程度轻重不一。比如有的患者会感觉肚子隐隐作痛，持续几个小时不等。腹胀： 肠道功能紊乱时，肠道的蠕动和消化吸收功能受到影响，容易出现腹胀情况，尤其是进食后，腹胀会更明显，肚子看起来鼓鼓的。
排便方面的症状
腹泻： 有的患者会出现腹泻，大便次数增多，可能一天会拉3 - 5次甚至更多，大便质地较稀，呈水样或不成形。便秘： 也有部分患者会出现便秘，大便干结，排便困难，间隔时间延长，可能好几天才排便一次。
全身伴随症状
乏力： 长期肠道功能紊乱可能会导致患者出现乏力的感觉，精神状态不佳，做事情容易疲倦。失眠： 肠道功能紊乱还可能影响睡眠，导致患者出现失眠症状，入睡困难或者睡眠浅，容易醒来。
其他表现
食欲改变： 有的患者会出现食欲减退，不想吃东西；而有的患者可能会出现食欲亢进，总是感觉饿。恶心呕吐： 少数患者可能会有恶心的感觉，严重时还会出现呕吐现象，但呕吐物一般是胃内的内容物。