食管良性肿瘤相对少见，治疗方法主要有手术治疗、内镜下治疗等。一般来说，手术是主要的治疗手段，多数患者通过手术可获得较好疗效。
手术治疗
开胸手术：
对于较大的食管良性肿瘤，可能需要开胸手术。这类手术适用于肿瘤位置较深、体积较大，传统内镜下治疗难以切除的情况。手术需要切开胸腔，暴露食管，将肿瘤完整切除。但开胸手术创伤相对较大，患者术后恢复时间较长，一般需要1 - 2周左右才能基本恢复正常饮食和活动。
胸腔镜手术：
这是一种微创的手术方式。胸腔镜手术通过几个小切口插入胸腔镜和手术器械进行操作。与开胸手术相比，胸腔镜手术创伤小，术后疼痛较轻，恢复较快，通常术后3 - 5天即可下床活动，1周左右可以出院，住院时间一般在7 - 10天左右。胸腔镜手术适用于部分较适合的食管良性肿瘤患者，尤其是肿瘤位置相对较表浅、体积不是特别巨大的情况。
内镜下治疗
内镜下黏膜切除术（EMR）：
对于较小的、局限于黏膜层或黏膜下层浅层的食管良性肿瘤，可采用内镜下黏膜切除术。这种方法是在内镜下用圈套器等器械将肿瘤所在的黏膜层完整切除。手术创伤极小，患者几乎没有明显伤口，术后恢复非常快，一般术后禁食1 - 2天，然后就可以逐渐恢复正常饮食，1周左右基本就能恢复日常活动。
内镜下黏膜下剥离术（ESD）：
如果肿瘤稍微大一些，但仍局限在黏膜下层，内镜下黏膜下剥离术是一种可行的方法。它可以将肿瘤完整地从食管壁的黏膜下层剥离下来。不过，ESD手术相对EMR技术要求更高，术后需要密切观察是否有出血、穿孔等并发症，一般术后需要住院观察2 - 3天，恢复时间大概在1 - 2周。
观察随访
对于一些非常小的、生长缓慢且没有任何症状的食管良性肿瘤，也可以考虑定期观察随访。一般建议每3 - 6个月进行一次胃镜检查，观察肿瘤的大小、形态等变化情况。如果在观察过程中发现肿瘤有增大趋势或者出现了吞咽困难等症状，就需要及时采取治疗措施。例如，对于直径小于1厘米且没有任何不适症状的极小食管平滑肌瘤等良性肿瘤，可以先定期随访观察。