食道反流症状主要有典型症状和非典型症状。典型症状中，烧心是很常见的，约有半数以上患者会出现，通常是胸骨后有烧灼感，一般在进食后1小时左右出现。反流也是典型症状之一，是指胃内容物反流到咽部或口腔，患者能感觉到有酸性物质或苦味物质反流上来。
非典型症状方面
呼吸道相关症状： 可能会引起咳嗽，这种咳嗽有时候容易被当作普通的呼吸道疾病来治疗。还有可能导致哮喘发作，有研究发现部分哮喘患者是由于食道反流引发的。口腔相关症状： 会出现牙齿问题，比如牙齿酸蚀症，长期的食道反流使得胃酸反复刺激牙齿，会让牙齿表面的牙釉质受损，影响牙齿健康。另外，还可能有口腔溃疡的情况，因为反流的胃酸刺激口腔黏膜，容易引发溃疡。
不同人群的特殊表现
儿童食道反流： 婴幼儿可能表现为拒食、喂养困难，还可能出现体重增长缓慢的情况。有些儿童会在进食后出现呕吐，呕吐物可能是胃内容物，严重的还可能伴有哭闹不安。老年人食道反流： 症状可能不典型，有的老年人可能主要表现为胸痛，容易被误诊为心绞痛。还有些老年人会有吞咽困难的情况，不过这种吞咽困难一般是间歇性的，在进食固体食物时可能更明显。