疟疾的症状通常有明显的阶段性表现。一般来说，疟疾患者会出现周期性的发作，通常间隔一段时间就会有症状出现。
典型的临床症状表现
寒战阶段： 患者会突然感到寒冷，寒战非常剧烈，皮肤苍白，口唇、指甲发绀，寒战持续约10分钟到2小时。此时体温开始上升。发热阶段： 接着体温迅速上升，可达39℃甚至更高，患者面色潮红，头痛、全身酸痛、口渴等症状明显，发热持续约2 - 6小时。出汗阶段： 之后患者大量出汗，体温骤降，可降至35℃左右，患者感觉乏力，但症状会明显缓解，出汗阶段持续约1 - 2小时。整个发作周期可能间隔1 - 4天不等，间日疟和卵形疟多间隔48小时发作一次，三日疟间隔72小时发作一次。
伴随的全身症状
全身不适： 除了周期性的寒战、发热、出汗外，患者在发作间歇期可能仍会有全身不适、乏力、食欲不振等情况。部分患者还可能出现恶心、呕吐等胃肠道症状。贫血： 长期反复发作的疟疾可能会导致患者出现贫血，表现为面色苍白、头晕、心悸等，这是因为疟原虫破坏红细胞，导致红细胞数量减少。肝脾肿大： 在疟疾发作过程中，肝脏和脾脏会出现肿大，尤其是慢性疟疾患者，脾脏肿大较为明显，这是由于疟原虫及其代谢产物刺激机体，引起单核 - 巨噬细胞增生所致。
脑型疟疾的特殊症状
对于脑型疟疾患者，会出现严重的神经系统症状。患者可能出现意识障碍，如嗜睡、昏迷等；还可能有抽搐、惊厥等表现，这是因为疟原虫侵犯脑部，影响神经系统功能。此外，脑型疟疾患者体温可能持续处于高热状态，病情较为凶险，如果不及时治疗，可能会危及生命。
其他特殊人群的疟疾症状特点
在儿童患者中，疟疾症状可能不典型，容易被忽视。儿童可能除了发热外，还可能出现哭闹不安、精神萎靡、呕吐频繁等症状，而且儿童疟疾发作可能更急骤，病情进展相对较快。而孕妇患疟疾时，除了自身出现上述典型症状外，还可能对胎儿产生影响，如导致胎儿发育不良、早产甚至死胎等情况。