小三阳是由乙肝病毒（HBV）感染引起的。乙肝病毒主要通过血液传播、母婴传播和性传播。比如，在母婴传播中，母亲如果是乙肝小三阳患者，在分娩过程中可能将病毒传给婴儿；血液传播常见于输入被乙肝病毒污染的血液或血制品，或者使用被病毒污染且未严格消毒的注射器、针灸针等医疗器械；性传播则是与乙肝小三阳患者发生无防护的性行为时，病毒可能通过性接触传播。
血液传播途径相关
输血或血制品：过去医疗条件有限时，曾有因输入被乙肝病毒污染的血液而感染乙肝的情况，但现在由于对献血者严格筛查乙肝病毒，这种情况已大大减少。不过，在一些医疗资源不发达地区，仍需警惕此类风险。医疗器械污染：一些不正规的医疗机构，如没有严格执行医疗器械消毒流程的诊所，使用被乙肝病毒污染的注射器等，就可能导致健康人感染乙肝病毒，从而发展为小三阳。
母婴传播途径相关
宫内感染：虽然宫内感染乙肝病毒的概率相对较低，约为5% - 10%，但也是乙肝母婴传播的一种方式。可能是在胎儿发育过程中，乙肝病毒通过胎盘感染胎儿。围生期感染：这是乙肝母婴传播的主要途径，占母婴传播的90%以上。分娩时，胎儿接触母亲的血液、羊水和阴道分泌物等，从而感染乙肝病毒。
性传播途径相关
无防护性行为：与乙肝小三阳患者发生无保护的性行为时，乙肝病毒可通过性接触传播。因为性接触过程中，皮肤或黏膜的破损可能使病毒侵入人体。而且，多个性伴侣会增加感染乙肝病毒的风险，据统计，有多个性伴侣的人群感染乙肝病毒的几率比单一性伴侣人群高。总之，小三阳主要是由乙肝病毒通过血液、母婴和性传播这几种途径感染人体后，人体免疫系统对病毒反应等因素逐渐发展而来的。