儿童脑炎的判断方法可以从临床表现、辅助检查等方面来进行。一般来说，儿童脑炎可能会出现发热、头痛、呕吐等症状，同时可能伴有精神状态改变，比如烦躁、嗜睡甚至抽搐等表现。
临床表现观察
发热情况： 儿童脑炎常常会出现发热症状，体温可能会达到38℃以上，而且发热可能持续不退或者反复发热。比如有的儿童可能连续几天体温都在39℃左右波动。神经系统症状： 会有头痛表现，小婴儿可能不会用语言表达头痛，会表现为哭闹不安。还可能出现呕吐，呈喷射性呕吐，这是因为颅内压增高引起的。另外，部分儿童会有精神萎靡，对周围环境反应差，大一点的孩子可能会说自己头晕等情况。严重的还可能出现抽搐，表现为肢体抽动、双眼上翻等。
辅助检查判断
腰椎穿刺检查： 通过腰椎穿刺获取脑脊液进行检查是重要的判断方法。正常脑脊液是清亮透明的，而脑炎患儿的脑脊液会有变化，比如白细胞计数可能会升高，一般会超过正常范围，蛋白质含量可能增高，糖和氯化物含量可能降低等。不过腰椎穿刺有一定的操作要求，要在正规医院由专业医生操作。影像学检查： 头颅磁共振成像（MRI）有助于发现脑部的异常改变。脑炎患儿的脑部可能会出现异常信号影，比如在T2加权像上可能会有高信号区域，提示脑部有炎症水肿等情况。头颅CT也可以辅助诊断，不过相对MRI来说，对于早期细微病变的发现不如MRI敏感，但也能看到一些脑部的大致情况，比如是否有脑水肿等。
实验室检查辅助
血常规检查： 血常规中白细胞计数及分类可能有变化。如果是病毒性脑炎，白细胞计数可能正常或轻度升高，淋巴细胞比例可能增高；如果是细菌性脑炎，白细胞计数通常会明显升高，中性粒细胞比例增高。通过血常规可以初步判断感染的大致类型，但不能确诊脑炎，但对判断病情有一定帮助。病毒学检查： 可以通过采集患儿的血液、脑脊液等标本进行病毒学检测，比如可以检测是否有特定病毒的抗原或抗体。如果能检测到相关病毒的特异性抗体，对病毒性脑炎的诊断有重要意义。例如，怀疑是乙脑病毒引起的脑炎，就可以检测乙脑病毒的抗体等。