脑膜炎后遗症的症状较多，常见的有认知障碍，约有30%左右的脑膜炎患者会出现不同程度的认知功能减退，表现为记忆力下降、注意力不集中等。
神经系统方面的症状
运动功能障碍：部分患者会出现肢体运动异常，比如一侧肢体无力，走路时步态不稳，严重的可能无法正常行走。有的还会出现肢体抽搐，也就是癫痫发作，癫痫发作的形式多样，可能是局部肢体抽搐，也可能是全身性的大发作。视力听力问题：一些患者会有视力下降的情况，可能是视神经受到影响导致的；还有些患者会出现听力减退，听力下降的程度不一，轻度的可能只是对某些声音不敏感，重度的可能几乎听不见声音。
精神心理方面的症状
情绪异常：患者可能会出现情绪不稳定，容易烦躁、焦虑，也可能变得抑郁，表现为情绪低落、对事物缺乏兴趣等。大约20% - 30%的脑膜炎后遗症患者会有抑郁表现。睡眠障碍：不少患者会出现睡眠问题，比如难以入睡，或者睡眠中容易惊醒，睡眠质量很差，长期的睡眠障碍又会进一步影响身体和心理状态。
其他方面的症状
头痛头晕：部分患者会持续存在头痛症状，疼痛程度因人而异，有的是轻微胀痛，有的则比较剧烈；同时还可能伴有头晕，感觉头重脚轻，影响日常活动。吞咽困难：少数患者会出现吞咽困难的情况，吃东西时容易呛咳，这是因为脑部相关神经受损影响了吞咽功能，严重的可能需要鼻饲来保证营养摄入。